Dideli vandens telkiniai pasižymi gausia ir įvairia ichtiofauna. Kai kurie dideli vandens telkiniai kaip Kuršių marios yra svarbios žuvų migracijoms. Dėl gausių žuvų išteklių dideli vandens telkiniai yra svarbūs tiek verslinei, tiek mėgėjiškai žvejybai. Todėl tokių vandens telkinių ichtiologiniai tyrimai turi ne tik mokslinę, bet ir praktinę reikšmę.